Lammps
作业文件说明
Lammps软件应用过程中,需要用到的作业文件包括:
- 计算文件,文件格式为*in,或 .lj 。
- 其他相关文件,文件格式为.restart,*airebo,*lcbop等。
准备好文件后,跟随下面步骤提交作业。
实践流程
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进入集群,提交作业
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指定作业运行需要的核心数
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选择软件及版本
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参数配置
选择作业计算文件,如.in/.lj文件等,其他文件传输到同一目录下。
说明:
lammps软件,平台做了内置的作业命令,不需要用户再提交其他命令文件,这里只需要上传计算执行文件即可。与计算执行文件相关的其他文件,需要放在共享存储的同一个目录文件夹下。如下图所示:
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提交作业
点击“提交作业”,系统将自动分配计算任务到计算节点,进入作业状态,点击右上角刷新按钮刷新作业状态。
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作业查看。
点击“作业详情”,即可查看作业结果文件。.out是作业日志文件,.err是错误日志文件。如下图所示:
在对应的作业结果文件中点击“查看”,即可在线查看作业运行详情,如下图所示:
点击“下载”,即可将作业文件下载到本地。
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作业列表详情显示。
在“作业列表”下,可以看到该集群下每一个作业的详情情况,包括作业状态、所属队列、所用的核心数、运行时长,总计核时等详细信息,如下图所示: